rsid
L'identificatore dbSNP, come rs429358. Gli identificatori interni 23andMe che iniziano con “i” possono essere importati, anche se i cataloghi pubblici potrebbero non avere una corrispondenza.
Hai già un file di dati grezzi 23andMe?
Carica l'esportazione originale separata da tabulazioni e trasforma i suoi rsID e genotipi in un referto strutturato. DNA Info Lab tiene separati registri clinici, evidenza sui farmaci e associazioni di ricerca, mostra ciò che il tuo chip non ha coperto e ti lascia ispezionare i riscontri gratuiti prima di scegliere il referto completo.
Qui compatibilità significa un contratto di parsing, non una lista commerciale di generazioni di kit. Il parser testato riconosce un banner 23andMe o le note righe separate da tabulazioni e convalida i campi utili riga per riga.
L'identificatore dbSNP, come rs429358. Gli identificatori interni 23andMe che iniziano con “i” possono essere importati, anche se i cataloghi pubblici potrebbero non avere una corrispondenza.
L'etichetta di cromosoma fornita dall'esportazione. Viene conservata con la variante importata.
La coordinata numerica fornita dal file. Una posizione malformata o non numerica viene rifiutata.
La coppia di alleli riportata. Le righe senza genotipo e i no-call 23andMe scritti come “--” vengono saltati.
Commenti, righe vuote, righe malformate e no-call “--” non diventano posizioni del referto. Un no-call saltato non è un risultato negativo: significa che quel file non ha un genotipo utilizzabile in quella riga.
Un file grezzo 23andMe contiene genotipi in posizioni selezionate misurate da un microarray. Non è una lettura di ogni base del tuo genoma né un sequenziamento del genoma o dell'esoma completo.
Questa distinzione cambia il significato di «non trovato». Se una variante è assente dal file, il chip potrebbe semplicemente non aver testato quella posizione. DNA Info Lab quindi riporta la copertura corrispondente e disponibile; non reinterpreta una riga mancante come un risultato protettivo.
Il referto non può nemmeno scoprire varianti strutturali, espansioni di ripetizioni o varianti fuori dalle posizioni rappresentate nell'esportazione. Un file consumer grezzo resta un input di screening ed educazione, mai un test diagnostico clinico.
L'importatore legge cromosoma, posizione e genotipo scritti nell'esportazione originale, ma attualmente non deduce una generazione di chip 23andMe, non rileva la build del genoma dal conteggio dei marcatori, non converte coordinate tra build di riferimento né riscrive gli alleli sull'altro filamento.
I join con i cataloghi sono ancorati sull'rsID. Questo evita di usare la posizione come identità della variante, ma non rende irrilevante l'orientamento dell'allele: lo scoring e le annotazioni farmacologiche specifiche per genotipo confrontano comunque gli alleli della riga importata. Usa l'esportazione originale del provider invece di un file modificato a mano o convertito.
Poiché il repository non ha fixture etichettati v3, v4 e v5, questa pagina non dichiara una lista testata di quelle versioni commerciali. La promessa supportata è il formato osservabile a quattro colonne descritto sopra.
Un genotipo utilizzabile viene confrontato con tre fonti di evidenza importate separatamente. Sono mostrate in sezioni diverse del referto perché i loro significati e i loro standard di evidenza sono diversi.
Il referto trova gli rsID presenti sia nel file sia nel catalogo ClinVar importato, poi mostra classificazione clinica, stato di revisione, condizione associata e record di origine. Una corrispondenza da chip richiede comunque conferma clinica.
Le annotazioni PharmGKB specifiche per genotipo possono comparire quando rsID e coppia di alleli corrispondono al record importato. Descrivono evidenza pubblicata sulla risposta ai farmaci; non prescrivono, sospendono né cambiano un farmaco.
Le associazioni di ricerca possono contribuire quando un genotipo riportato contiene l'allele d'effetto del catalogo. Il referto conserva tratto misurato, contesto dello studio, unità dell'effetto e fonti invece di trasformare associazioni in diagnosi.
Array e generazioni di prodotto diversi misurano insiemi di posizioni diversi. Due esportazioni 23andMe valide possono quindi produrre conteggi, sovrapposizioni con i cataloghi e aree vuote differenti anche quando entrambe sono analizzate correttamente.
Anche la copertura dei cataloghi varia: un marcatore può essere nel tuo file ma assente dai set di dati filtrati che DNA Info Lab serve attualmente, oppure presente in una fonte senza soddisfare le regole di evidenza del prodotto. Viceversa, una variante fisica può avere diversi studi o record di condizione; l'interfaccia tiene distinte queste unità.
Non è promesso alcun numero minimo di riscontri. Il risultato utile può includere aree esplicite senza corrispondenze supportate, perché una dichiarazione di copertura onesta vale più di una pagina riempita con associazioni deboli.
La demo pubblica usa genotipi sintetici e i componenti del referto di produzione. Puoi ispezionare le modalità semplice e scientifica, ClinVar, la farmacogenomica, le fonti GWAS e il confine premium senza creare un account né esporre il DNA di una persona reale.
Apri il referto sintetico →Usa la guida al download del provider per ottenere l'esportazione grezza. Tienila compressa se fornita come ZIP e non aprirla e risalvarla in un foglio di calcolo, che può alterare identificatori o formattazione.
Come scaricare i dati grezzi 23andMe →Il server analizza il file originale in memoria ed elimina quel caricamento. Le varianti estratte e i risultati derivati del referto sono conservati sull'infrastruttura UE del servizio così l'account può tornare all'analisi, secondo l'eliminazione e le regole di conservazione applicabili.
DNA Info Lab supporta il formato testato e osservabile a quattro colonne separate da tabulazioni descritto in questa pagina. Attualmente non dichiara una lista di compatibilità v3/v4/v5 perché non esistono fixture etichettati per versione che provino ogni generazione.
No. Analizza genotipi già presenti nella tua esportazione da microarray consumer. Non avviene alcuna nuova misurazione biologica o sequenziamento.
No. Il chip potrebbe non testare quella posizione, la riga potrebbe essere un no-call o il catalogo filtrato potrebbe non avere corrispondenze supportate. L'assenza da questo referto non è evidenza clinica di assenza.
No. L'importatore conserva le coordinate dell'esportazione sorgente e abbina i record dei cataloghi per rsID. Non deduce la build, non converte coordinate né cambia l'orientamento del filamento.
No. Le annotazioni PharmGKB descrivono evidenza pubblicata genotipo-farmaco. Le decisioni sui farmaci spettano a un professionista sanitario qualificato che conosca il contesto clinico completo.
No. Prima vengono l'elaborazione del file e i riscontri gratuiti definiti. Il referto completo è un acquisto unico opzionale, senza abbonamento.
L'esempio pubblico è sintetico per scelta. Mostra il prodotto senza pubblicare né indicizzare i dati genetici di un'altra persona.
Inizia con l'analisi gratuita, vedi cosa copre questo specifico file e sblocca il referto completo solo se i riscontri supportati ti sono utili.
Analizza il mio file 23andMe →